依托完善的生态与良好的兼容性，国家超级计算郑州中心面向众多不同领域与行业应用需求，提供高性能计算、人工智能、大数据、行业应用等软件资源服务。其中应用开发基础环境由编程模型、编译系统、并行开发运行环境组成，支持MPI-1/MPI-2/MPI-3标准，支持OpenMP，兼容OpenCL和CUDA环境，编译器支持标准的C/C++、Fortran等语言，为用户的开发和调试提供极大的便利。行业应用软件主要面向各个行业应用领域提供软件服务功能。
基础构架
行业软件
abinit |
abinit | apps/abinit/8.10.3/hpcx-2.4.1-intel2017 |
amber |
amber | apps/amber/AmberTools20/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
bigDFT |
bigDFT | apps/bigDFT/1.8.3/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| Calculix | Calculix | apps/Calculix/2.16/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| Code_Aster | Code_Aster | apps/Code_Aster/13.8/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| cp2k | cp2k |
apps/cp2k/5.1.0/hpcx-2.4.1-gcc7.3.1 apps/cp2k/6.1.0/hpcx-2.4.1-intel2017 apps/cp2k/6.1.0/intelmpi apps/cp2k/8.1.0/cp2k-8.1.0-hpcx-2.7.4-gcc-7.3.1 apps/cp2k/8.2.0/cp2k-8.2.0 apps/cp2k/9.1.0/cp2k-9.1.0 |
gamess-us |
gamess-us | apps/gamess-us/2019R2/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| hoomd-DCU | hoomd-DCU | apps/hoomd-DCU/2.9.0/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| lammps | lammps |
apps/lammps/23Jun2022/intelmpi-2017.4.239 apps/lammps/29Oct2020/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 apps/lammps/3Mar20/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 apps/lammps/7Aug19/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| lammps-DCU |
apps/lammps-DCU/23Jun2022/hpcx-gcc-7.3.1-dtk22.04.2 apps/lammps-DCU/24Dec2020/dtk-21.10.1/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 apps/lammps-DCU/24Jan20/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
|
MiniFE |
MiniFE | apps/MiniFE/2.1.0/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| MISA | MISA-AKMC | apps/MISA-AKMC/v0.1.0-beta |
| MISA-MD | apps/MISA-MD/v0.4.0 |
|
| MISA-MD-DCU | apps/MISA-MD-DCU/v0.4.0-beta |
|
| MISA-SCD | apps/MISA-SCD/v1.0.0 |
|
| NAMD | NAMD | apps/NAMD/2.13/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| NAMD-DCU |
apps/NAMD-DCU/2.13/rocm2.9/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 apps/NAMD-DCU/2.13/rocm3.3/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 apps/NAMD-DCU/2.15a/rocm3.3/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 apps/NAMD-DCU/3.0a/rocm3.9.1/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 apps/NAMD-DCU/3.0a/rocm4.0.1/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 |
|
| nwchem | nwchem | apps/nwchem/6.8.1/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| nwchem-DCU | apps/nwchem-DCU/6.8.1/hpcx-2.4.1-intel2017 |
|
| openmx | openmx | apps/openmx/3.9.2/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| openbabel | openbabel | apps/openbabel/3.1.1 |
| OpenMM-DCU | OpenMM-DCU |
apps/OpenMM-DCU/7.4.1/gcc-7.3.1 apps/OpenMM-DCU/7.5.0/gcc-7.3.1 |
| PEET | PEET | apps/PEET/Particle-1.15.0 |
| phonopy | phono3py | apps/phono3py/1.21.0 |
| phonopy | apps/phonopy/2.8.1 |
|
| qmcpack | qmcpack | apps/qmcpack/3.9.1/hpcx-2.4.1-gnu |
| siesta | siesta | apps/siesta/4.0.2/hpcx-2.4.1-intel2017 |
| quantum_espresso | quantum_espresso | apps/quantum_espresso/6.5/hpcx-2.4.1-intel2017 |
提示：上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件，用户可通过设置环境变量直接使用。用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求，可联系相关工作人员 | ||
amber |
amber |
apps/amber/AmberTools20/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| AlloType | AlloType | apps/AlloType/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| AutoDock-DCU | AutoDock-DCU | apps/AutoDock-DCU/4.2.6/gcc-7.3.1 |
| bcftools | bcftools |
apps/bcftools/1.12/gcc-7.3.1 |
| bedtools | bedtools | apps/bedtools/2.29.1/gcc-7.3.1 |
| blast |
blast | apps/blast/2.10.0 |
| blastn-DCU | apps/blastn-DCU/2.2.28/gcc-7.3.1 |
|
| blastp-DCU | apps/blastp-DCU/2.2.28/gcc-7.3.1 |
|
| bwa | bwa | apps/bwa/0.7.17/gcc-7.3.1 |
| canu | canu | apps/canu/1.8/gcc-7.3.1 |
| ccpem | ccpem | apps/ccpem/1.5.0 |
| cisTEM | cisTEM | apps/cisTEM/1.0.0/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| coot | coot | apps/coot/0.9.4.1 |
| ctffind | ctffind | apps/ctffind/4.1.14 |
| ctftilt | ctftilt | apps/ctftilt/ctf/V1.7 |
| FastQC | FastQC | apps/FastQC/0.11.9 |
| GATK |
GATK | apps/GATK/4.1.2.0 |
| gromacs | gromacs |
apps/gromacs/2022/hpcx-2.7.4-gcc731 apps/gromacs/2022-intel2017/hpcx-2.4.1 |
| gromacs-DCU |
apps/gromacs-DCU/2018.7/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 apps/gromacs-DCU/2020.1/hpcx-v2.4.1-gcc-7.3.1 apps/gromacs-DCU/2020.1/hpcx-v2.7.4-gcc-7.3.1 apps/gromacs-DCU/2020.3/hpcx-v2.7.4-gcc-7.3.1 apps/gromacs-DCU/2020.3/hpcx-v2.7.4-gcc-7.3.1-vkfft |
|
| Medical-School | Medical-School | apps/Medical-School/R-Language/R-4.0.3 |
| picard | picard | apps/picard/2.21.9 |
| relion | relion-DCU | apps/relion-DCU/3.0.7/hpcx-2.4.1-gcc-7.3.1 |
| relion-GUI |
apps/relion-GUI/3.0.7/rocm-3.9.1 |
|
| ResMap | ResMap |
apps/ResMap/1.1.4 |
| samtools | samtools | apps/samtools/1.9/gcc-7.3.1 |
| Situs | Situs | apps/Situs/3.1 |
| summovie |
summovie | apps/summovie/1.0.2 |
| Trimmomatic | Trimmomatic |
apps/Trimmomatic/0.3.8 |
提示：上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件，用户可通过设置环境变量直接使用。用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求，可联系相关工作人员 | ||
| envi | envi | apps/envi/2017.08 |
| envi56 | apps/envi56/2017.08 |
|
| gsac | gsac | apps/gsac/PROGRAMS.330 |
| SAC | SAC | apps/SAC/1016a |
| WRF | WRF |
apps/WRF/3.9.1/hpcx-2.4.1-intel2017 apps/WRF/4.1.3/hpcx-2.4.1-intel2017 |
提示：上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件，用户可通过设置环境变量直接使用。用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求，可联系相关工作人员 | ||
编译并行环境
序号 |
分类 |
编译环境 |
备注 |
1 |
编译器 |
gcc/g++ gfortran |
gcc/g++：7.3.1 gfortran：7.3.1 |
2 |
DCU异构编程环境 |
HIP编译器hipcc hcc编译器hcc opencl编译器hcc |
HIP编译器hipcc：2.8.19361 hcc编译器hcc：2.8.19361 opencl编译器hcc：2.8.19361 |
3 |
并行编程环境 |
hpcx-2.4.1、hpcx-2.6.0、 hpcx-2.7.4 |
MPI：hpcx-2.4.1、hpcx-2.6.0、hpcx-2.7.4 |
用户须知：
1.上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件，用户可通过设置环境变量直接使用；
2.如果用户已经购买或通过其它方式获取了相关软件的许可，需要在“嵩山”超级计算机上使用这些软件，请用户安装在本人工作目录下，仅限用户本人使用并对其合法性负责；
3.用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求，可联系相关工作人员。