依托完善的生态与良好的兼容性,国家超级计算郑州中心面向众多不同领域与行业应用需求,提供高性能计算、人工智能、大数据、行业应用等软件资源服务。其中应用开发基础环境由编程模型、编译系统、并行开发运行环境组成,支持MPI-1/MPI-2/MPI-3标准,支持OpenMP,兼容OpenCL和CUDA环境,编译器支持标准的C/C++、Fortran等语言,为用户的开发和调试提供极大的便利。行业应用软件主要面向各个行业应用领域提供软件服务功能。
行业应用软件
序号 |
应用领域 |
应用软件(DCU) |
应用软件(CPU) |
1 |
计算化学、材料、物理、分子动力学等领域 |
Gromacs-DCU Lammps-DCU Nwchem-DCU Hoomd-DCU MISA-MD-DCU NAMD-DCU |
ABINIT、Amber、BigDFT 、 CalculiX、Code_Aster、CP2K、 GAMESS-US、Gromacs、Lammps、 MiniFE、MISA-AKMC、MISA-MD、 MISA-SCD、NAMD、NWChem、 Openmx、Openbabel、Phono3py、 Phonopy、QMCPACK、SIESTA、 Quantum Espresso、Vtst |
2 |
计算生物学、精准医疗领域 |
AutoDock-DCU Barracuda-DCU OpenMM-DCU Relion-DCU |
Amber、AlloType、BCFtools、 Bedtools、BLAST+、BWA、 Canu、Ccpem、cisTEM、 Coot、Ctftilt、Ctffind、FastQC、 GATK、Medical-school、Picard、 ResMap、Samtools、Situs、 Summovie、Trimmomatic |
3 |
气象、海洋、天文、环境模拟领域 |
/ |
ENVI、Gsac、GrADS、SAC、WRF |
4 |
流体力学、结构分析领域 |
/ |
Elmer、FDS、OpenFOAM |
5 | 人工智能等领域 |
DeepLearnring Mxnet PaddlePaddle Pytorch TensorFlow |
/ |
提示:上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件,用户可通过设置环境变量直接使用。用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求,可联系相关工作人员。 |
基础软件
序号 |
分类 |
基础软件 |
1 |
工具类 |
Anaconda、ANTLR、CDO、 Automake、cURL、DUNE、 FlameGraph、HDF4、HDF5、 Hwloc、IPM、OpenGrADS、 MONO、NCO、Ncview、 Octave、Octopus、JDK、 ParaView、Python、Qt、R、 ScaLAPACK、Singularity、SU2、 Spider、wxWidgets |
2 |
函数库 |
Boost、Eigen、FFTW、 GDAL、GRIB2、GRIB_API、 GSL、HTSlib、I/O API、 LAPACK、LibPNG、LIBXC、 MIOpen、NetCDF、OpenBLAS、 OpenCV、PnetCDF、PROJ、 SQLite、UDUNITS、Zlib |
3 | 图像工具 |
EMAN、Frealigm、Gnuplot、 Grace、ImageMagick、IMOD、 JasPer、NCL_NCARG、Ploticus、 OpenJPEG、Protomo、Unblur |
编译并行环境
序号 |
分类 |
编译环境 |
备注 |
1 |
编译器 |
gcc/g++ gfortran |
gcc/g++:7.3.1 gfortran:7.3.1 |
2 |
DCU异构编程环境 |
HIP编译器hipcc hcc编译器hcc opencl编译器hcc |
HIP编译器hipcc:2.8.19361 hcc编译器hcc:2.8.19361 opencl编译器hcc:2.8.19361 |
3 |
并行编程环境 |
hpcx-2.4.1、hpcx-2.6.0、 hpcx-2.7.4 |
MPI:hpcx-2.4.1、hpcx-2.6.0、hpcx-2.7.4 |
用户须知:
1.上述软件列表为先进计算平台部分已安装的软件,用户可通过设置环境变量直接使用;
2.如果用户已经购买或通过其它方式获取了相关软件的许可,需要在“嵩山”超级计算机上使用这些软件,请用户安装在本人工作目录下,仅限用户本人使用并对其合法性负责;
3.用户如有软件的移植、安装、兼容性测试需求,可联系相关工作人员。